In biologia molecolare, STRING (Strumento di ricerca per il recupero di geni/proteine interagenti) è un database biologico e una risorsa web di interazioni proteina-proteina note e previste. … L'ultima versione 11b contiene informazioni su circa 24,5 milioni di proteine provenienti da più di 5000 organismi.
Qual è lo scopo del database STRING?
Il database STRING mira a raccogliere e integrare queste informazioni, consolidando i dati di associazione tra proteine note e previste per un gran numero di organismi.
Che cos'è un punteggio STRING?
In STRING, ogni interazione proteina-proteina è annotata con uno o più 'punteggi'. È importante sottolineare che questi punteggi non indicano la forza o la specificità dell'interazione. Invece, sono indicatori di fiducia, ovvero quanto è probabile che STRING ritenga vera un'interazione, date le prove disponibili.
Perché le proteine interagiscono?
Le interazioni proteina-proteina (PPI) sono contatti fisici ad alta specificità stabiliti tra due o più molecole proteiche come risultato di eventi biochimici guidati da interazioni che includono forze elettrostatiche, idrogeno legame e l'effetto idrofobico.
Cos'è l'associazione funzionale?
definizione. Relazione binaria tra entità biologiche quando una di esse modula l' altra in termini di funzione, espressione, degradazione o stabilità dell' altra e della relazionetra i partner non può essere accertato come diretto, quindi sono implicitamente presenti passaggi intermedi.