Quando usare la poliacrilammide e quando l'agarosio?

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Quando usare la poliacrilammide e quando l'agarosio?
Quando usare la poliacrilammide e quando l'agarosio?
Anonim

I gel di agarosio sono usati con il DNA, a causa delle maggiori dimensioni delle biomolecole (i frammenti di DNA sono spesso migliaia di kDa). Per i gel proteici, la poliacrilammide fornisce buona risoluzione, poiché la dimensione molto più piccola (50 kDa è tipica) è più adatta per gli spazi intermolecolari più stretti del gel.

Qual è la differenza tra l'elettroforesi su gel di agarosio e l'elettroforesi su gel di poliacrilammide?

La principale differenza tra agarosio e poliacrilammide è che agarosio viene utilizzato nell'elettroforesi su gel di agarosio (AGE) principalmente per la separazione del DNA, mentre la poliacrilammide viene utilizzata nel gel di poliacrilammide elettroforesi (PAGE) principalmente per la separazione delle proteine.

Perché i gel di poliacrilammide sono migliori del gel di agarosio?

I gel di poliacrilammide presentano i seguenti tre vantaggi principali rispetto ai gel di agarosio: (1) Il loro potere risolutivo è così grande che possono separare molecole di DNA le cui lunghezze differiscono di appena lo 0,1% (cioè 1 bp su 1000 bp). (2) Possono contenere quantità di DNA molto maggiori rispetto ai gel di agarosio.

Perché la poliacrilammide viene utilizzata al posto dell'agarosio per la caratterizzazione delle proteine?

Il poliacrilammide e l'agarosio sono due matrici di supporto comunemente utilizzate nell'elettroforesi. … L'agarosio ha una grande dimensione dei pori ed è adatto per separare acidi nucleici e grandi complessi proteici. Il poliacrilammide ha una dimensione dei pori più piccola ed è ideale perseparando la maggior parte delle proteine e gli acidi nucleici più piccoli.

Perché si usa il gel di poliacrilammide?

L'elettroforesi su gel di poliacrilammide (PAGE) è usata di routine per l'analisi delle proteine e può essere utilizzata anche per separare frammenti di acido nucleico inferiori a 100 bp. Gli acidi nucleici vengono solitamente analizzati utilizzando un sistema tampone continuo in cui vi è una composizione tampone, un pH e una dimensione dei pori costanti in tutto il gel.

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