Al contrario, la maggior parte delle ligasi del DNA eucariotico, insieme agli enzimi arcaici e batteriofagi, rientrano nella seconda sottofamiglia; questi enzimi utilizzano l'ATP come cofattore.
Le ligasi richiedono ATP?
Sono comunemente usate due DNA ligasi. … La ligasi T4 richiede ATP mentre la ligasi E. coli richiede NAD+ (Nicotinamide adenina dinucleotide è un coenzima costituito da 2 nt uniti attraverso i loro gruppi fosfato). Entrambi catalizzano l'unione di un gruppo 5′-fosfato e un gruppo 3′-OH per formare un legame fosfodiestere.
Perché le ligasi hanno bisogno di ATP?
Le due fasi della reazione di legatura del DNA
La stessa reazione di legatura del DNA ha due fasi fondamentali. In primo luogo le estremità del DNA devono scontrarsi per caso e rimanere insieme abbastanza a lungo da consentire alla ligasi di unirsi a loro. … Per consentire all'enzima di effettuare ulteriori reazioni, l'AMP nel sito attivo dell'enzima deve essere reintegrato con ATP.
Quali sono le funzioni delle ligasi?
Le ligasi del DNA svolgono un ruolo essenziale nel mantenere l'integrità genomica unendo le rotture nella spina dorsale del fosfodiestere del DNA che si verificano durante la replicazione e la ricombinazione, e come conseguenza del danno al DNA e dei suoi riparazione. Tre geni umani, LIG1, LIG3 e LIG4 codificano per le ligasi del DNA dipendenti dall'ATP.
Che cosa sono le ligasi? Funzionano attivamente o passivamente?
DNA ligasi è attiva durante il processo di replicazione, riparazione e ricombinazione del DNA. È ampiamente applicato nella riparazione di single-strandrotture nel DNA duplex degli organismi viventi utilizzando il filamento complementare della doppia elica come modello, mentre alcune forme possono riparare specificamente i danni del doppio filamento.
