Poiché i DdNTP hanno una molecola di idrogeno (-H) invece di un gruppo ossidrile (-OH) attaccato al 3'-C del suo desossiribosio, non possono legarsi a nessun nucleotide in entrata. Pertanto, aggiunta di DdNTP durante la replicazione del DNA può essere utilizzata per terminare la reazione di sintesi.
Perché la sintesi del DNA si interrompe quando un ddNTP viene incorporato nel filamento di DNA in crescita?
Se il nucleotide aggiunto è un "dideossinucleotide" (Figura 6.29), l'estremità 3' del filamento in crescita ora avrà un H, anziché un OH. Ciò impedirà l'aggiunta di ulteriori nucleotidi; cioè, la sintesi del DNA in vitro si fermerà a questo punto.
Come fa un ddNTP a terminare la sintesi del DNA?
Quando un ddNTP viene incorporato in una catena di nucleotidi, la sintesi termina. Questo perché la molecola ddNTP manca di un gruppo idrossile 3', che è necessario per formare un collegamento con il successivo nucleotide nella catena.
Perché i DdNTP terminano il processo di replica?
Metodi di laboratorio in Enzimologia: DNA
Dideoxynucleotide I trifosfati sono prontamente incorporati in una catena di DNA in crescita, ma mancano del gruppo idrossile 3′ necessario per consentire alla catena di continuaree terminare efficacemente la polimerizzazione.
Perché i dideossinucleotidi causano l'arresto della replicazione del DNA?
Questi ddNTP mancano di un gruppo 3′-OH necessario per la formazione di un legame fosfodiestere tra duenucleotidi, che provocano l'interruzione dell'estensione del filamento di DNA quando viene aggiunto un ddNTP.
