Poiché la sonicazione può potenzialmente degradare le proteine e denaturare epitopi proteici, abbiamo quindi valutato l'impatto della sonicazione sull'integrità delle proteine.
La sonicazione può danneggiare le proteine?
Risposte popolari (1)
Protocollo di sonicazione standard piuttosto non può causare la frammentazione delle proteine- l'energia è troppo bassa. Non dovrebbe nemmeno causare la sua denaturazione. Può essere denaturato quando lo si sonic troppo a lungo e si surriscalda il campione. Se si utilizza la cromatografia al nichel, altre bande potrebbero essere semplicemente impurità.
La sonicazione può rompere i legami peptidici?
La sonicazione normalmente non può rompere la struttura primaria di una proteina perché quella struttura (la sequenza di amminoacidi) è costituita da legami covalenti che sono molte volte più forti dei legami idrogeno e la sonicazione può fornire l'energia necessaria per rompere quei legami.
La sonicazione rompe la membrana nucleare?
Una una breve sonicazione a bassa energia può interrompere la membrana plasmatica senza rompere troppe membrane mitocondriali o nucleari che si arrendono ai mitocondri tattili.
La sonicazione è necessaria per l'estrazione delle proteine?
La solubilizzazione del detergente (ad es. SDS) necessaria per l'isolamento delle proteine di membrana si traduce in una colla simile al lisato principalmente a causa degli acidi nucleici. La sonicazione è quindi necessaria in questi casi per interrompere questi acidi nucleici. La sonicazione genera molto calore e non va bene permolte proteine.
